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NEWS开拓创新:通过金年会金字招牌至上网站实现摩尔浓度可视化的DNA质控
来源:赫连娇健 日期:2025-02-27核心观点提炼:质量 vs 摩尔浓度:在生物医疗领域,特别是在长读长测序的质量控制中,样本的摩尔浓度应被优先关注,而非传统的样本质量评估。
相较于传统方法,FemtoPulse系统通过提供摩尔浓度视图,不仅消除了质量偏差,还为长读长测序提供了更为精准的结果预测。这一系统结合了ProSize数据分析软件,使用户能够以摩尔浓度为单位进行样本可视化,从而优化数据分析流程。
ProSize软件通过精确分析不同片段大小的摩尔浓度,帮助研究者判断是否需要进行额外的片段筛选。在基因组研究中,尤其是在长读长测序时,样本的质量控制是确保数据质量的关键步骤。传统方法通常侧重于样本的质量分布(如通过RFU值测量),然而这种方法在处理长读长测序样本时存在局限性,主要是因为测序读取数与片段的摩尔浓度, 而非质量,更为相关。
安捷伦的FemtoPulse系统能够自动化进行DNA脉冲场电泳分析,并通过ProSize软件在分析中将Y轴单位从质量(ng/μL)切换到摩尔浓度(nmol/L),提供更为精准的分析。这种方法使研究人员能够根据DNA片段的摩尔浓度来准确预测长读长测序的读长。
在使用FemtoPulse系统分析Sacl酶切的LambdaDNA样本时,发现虽三个片段的摩尔浓度相似,但在传统质量视图下,较短片段的峰高明显低于较长片段。在摩尔浓度视图下,这种差异则消失,从而提供了更均衡的数据视图。
Smear分析是长读长测序准备过程中不可或缺的一步,FemtoPulse系统还可以定量不同大小区间内的DNA片段摩尔浓度,帮助研究者判断是否需进行进一步的片段筛选。这对于优化文库准备流程、提高测序效率尤为重要。
总的来说,安捷伦FemtoPulse系统在长读长测序样本分析中,通过摩尔浓度的可视化,为研究人员提供了精确的工具,帮助优化样本准备流程,提高数据质量,并为测序结果的预测提供强有力的支持,有助于推动金年会金字招牌至上网站的生物医疗研究发展。
安捷伦FemtoPulse系统为高准确度分析高分子量DNA样品提供了出色的解决方案,其脉冲场电泳技术能够为高达165kb的DNA样品提供准确的定量与定性分析,这对评估长读长测序文库的质量、预测平均读长至关重要。
与其他基于非变性凝胶的分析仪器相比,FemtoPulse系统的突出优势在于其对核酸弥散条带和片段的卓越灵敏度,使其能够检测低丰度样品,成为高灵敏度分析RNA或cfDNA样品的理想选择。
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